Năm học 1965-1966 lần đầu tiên học sinh xã Long Thành được học cấp 2 tại trường xã. Năm học đó trường cấp 1 Long Thành đã có thêm 1 lớp 5 ( lớp đầu cấp 2) nên gọi là trường cấp 1-2 xã Long Thành. Năm học 1966- 1967 thực hiện chủ trương của cấp trên trường tách thành trường cấp 2 Long Thành gồm có 2 lớp ( một lớp 5 và một lớp 6), đóng tại Vườn Chè, làng Giáp Ngói. Năm học 1970- 1971 trường chuyển về cồn Điêu, làng Giáp Ngói, xã Long Thành và cũng là vị trí hiện nay trường đang đóng. Năm học 1981- 1982, thực hiện chủ trương chung của toàn ngành giáo dục trường cấp 1 và cấp 2 Long Thành được nhập thành trường PTCS Long Thành. Trường có 2 phân hiệu, phân hiệu chính đặt tại vị trí hiện nay, phân hiệu 2 đặt ở xóm Văn Trai. Năm học 1986 -1987 theo quyết định của UBND huyện trường PTCS Long thành, tách thành 2 trường: PTCS Long Thành 1 và PTCS Long Thành 2. Năm học 1991-1992 bộ phận cấp 2 thuộc trường PTCS Long Thành 2 được tách ra và nhập về với trường PTCS Long Thành 1 thành trường PTCS Long Thành. Năm học 1995-1996 trường PTCS Long Thành tách thành trường Tiểu học Long Thành và trường THCS Long Thành. Tháng 7/2011 trường được đổi tên thành trường THCS Hoàng Tá Thốn.
Đã gần 60 năm trôi qua, cùng với sự phát triển và đổi mới của đất nước, mái trường thân yêu này đã không ngừng phát triển và lớn mạnh. Phát huy truyền thống của cha anh, các thế hệ giáo viên và thế hệ học trò hôm nay cũng không ngừng phấn đấu nên đã có rất nhiều em học sinh đạt học sinh giỏi cấp tỉnh,cấp huyện, các thầy cô đạt các danh hiệu chiến sĩ thi đua. Đặc biệt năm học 2023-2024 nhà trường có 8 em dự thi HSG cấp tỉnh ở các môn: 01 giải nhì Hóa Học, 01 giải ba Lịch sử, 01 giải KK GDCD, 01 giải ba GDTC nội dung bóng chuyền, 01 giải ba KHKT, 01 giải nhì Hát dân ca. Đặc biệt có 02 giải nhất huy chương vàng cấp Quốc gia nội dung bóng chuyền Nam. Nhà trường xếp thứ 2/33 trường, đạt TTXS cấp huyện, có 02 GV đạt chiến sĩ thi đua cơ sở cấp Tỉnh, 01 Chủ tịch UBND Tỉnh tặng Bằng khen, 6 chiến sĩ cơ sở, 04 giáo viên được Chủ Tịch UBND huyện tặng giấy khen. Trường được cờ thi đua chủ Tịch Tỉnh, Bộ GD tặng Bằng khen. Trường Hoàng Tá Thốn đã trải qua bao thăng trầm với nhiều lần tách nhập, nhưng ở trong hoàn cảnh nào thầy trò của trường cũng luôn phấn đấu gìn giữ truyền thống và giữ vững trường đạt KĐCL mức 3 và đạt chuẩn Quốc Gia cấp độ 2.